分析：此題考查的是生物圈的內容，據此答題．
解答：解：A、空氣、水和土壤是生物生存的三要素，干凈的空氣、清潔的淡水和肥沃而沒有受到污染的土壤，能使萬物欣欣向榮地生長和繁衍．不符合題意．
B、日光不易穿透深層海洋，不適合生物的生存，因此深海中生物較少，但也有生物存在，如珊瑚蟲、海星和部分微生物等．不符合題意．
C、生物圈包括大氣圈的底部、巖石圈的表面和水圈的大部，生物主要生活在這個范圍之內，但大氣圈的上部、巖石圈的內部以及水圈的底層也有少量生物的存在．不符合題意．
D、生物圈包括大氣圈的底部、巖石圈的表面和水圈的大部，人類可以借助工具到達生物圈的各個圈層．符合題意．
故選：D
點評：生物圈的知識是中考的熱點，要重點掌握，并能靈活答題．
