解答：解：（1）同種生物同一性狀的不同表現形式叫做相對性狀，牛的毛色的黑色和棕色就是一對相對性狀；在一對相對性狀的遺傳過程中，子代個體出現了親代沒有的性狀，則親代個體表現的性狀是顯性性狀，子代新出現的性狀一定是隱性性狀，由一對隱性基因控制；因此如果兩頭黑牛交配，產下了一頭棕色子牛，則黑色和棕色這對相對性狀中，黑色是顯性性狀，棕色是隱性性狀．
若用B和b表示牛的毛色的顯性基因和隱性基因，兩頭黑牛交配產下了一頭棕色子牛，則棕色牛的基因組成是bb，這對基因由兩頭黑牛各提供一個，即親代黑牛的基因組成是Bb．如圖1所示：
（2）由遺傳圖解可知：上述兩頭黑牛產下一黑色子牛的可能性是75%即3/4，該黑色子牛的基因型為BB的可能性是25%即1/4．
（3）細胞核是遺傳信息庫，染色體位于細胞核中；某農科院利用棕色公牛的體細胞的細胞核和黑色母牛的去核卵細胞，組成重組細胞，經過多次分裂后，植入另一頭黑色母牛的子宮孕育，則所生牛犢的遺傳物質全部來自于棕色公牛的體細胞的細胞核，因此將來發育成的小牛的性別是公牛，體色是棕色．
（4）已知牛角的基因組成與性狀表現的關系如表所示，一頭有角母牛生了一頭無角小牛．從表格中可知有角母牛的基因組成是HH，遺傳給無角小牛的基因一定是H，而無角的基因組成只有hh或Hh兩種．因此無角小牛的基因組成是Hh，從表格中看出無角小牛Hh的性別是雌性．
故答案為：
（1）Bb；Bb；
（2）75%；
（3）公牛；棕色；
（5）雌性；Hh．
